京都のネズミ駆除業者おすすめ7選｜費用相場・助成金・相談窓口【2026年】

町家の天井裏から足音がする、仏壇のお供えがかじられていた。京都でネズミに気づいたとき、まず知りたいのは「市に頼めるのか」「業者に頼むといくらかかるのか」「町家でも対応してくれる業者はどこか」ではないでしょうか。

この記事では、京都市の衛生年報で公表されている区別のネズミ駆除指導件数、医療衛生センターと府が案内する相談先、京都市内でネズミ駆除を行う地元業者7社の料金と作業内容を、公式に確認できた事実だけで整理しました。町家や連棟住宅の施工事例、府の登録一覧で業者を確かめる方法もあわせて紹介します。

京都市のネズミ事情｜指導件数は右京区が最多

京都市衛生年報によると、市の医療衛生センターが行ったネズミ駆除の指導は、令和4年度165件、令和5年度189件でした。令和5年度を区別に見ると、右京区が33件で最も多く、北区23件、上京区22件、中京区21件と続きます。市内のどの区でも相談があることがわかります。

区	令和5年度の指導件数	担当の医療衛生センター
北区	23件	北東部
上京区	22件	北東部
左京区	19件	北東部
東山区	9件	北東部
中京区	21件	中部
下京区	16件	中部
山科区	12件	南東部
南区	9件	南東部
伏見区	18件	南東部
右京区	33件	西部
西京区	7件	西部
合計	189件

京都市の「ご家庭でできるネズミ対策」では、家に出るネズミとして次の3種類を比べています。

種類	体長	よくいる場所	警戒心
ドブネズミ	20〜26cm	下水、床下	弱い
クマネズミ	15〜20cm	天井裏、ビルなど高い所	非常に強い
ハツカネズミ	6〜9cm	草地、納屋	―

町家・連棟住宅はつながった天井裏に注意

京都には、京町家や、壁と屋根がつながった連棟住宅が多くあります。古い木造で、土壁や梁のすき間、点検口のない天井裏が多いため、侵入口を見つけにくいのが特徴です。グラックスは京都市北区の連棟住宅で、住戸全体をまとめて追い出してから侵入口を閉鎖した事例（2026年1月）を公開しています。

ネズミがいるサイン

• 台所や押入れの隅に、黒い米粒のような糞が落ちている
• 食品の袋や段ボール、電気コードにかじった跡がある
• 壁の下や配管のまわりが体の脂で黒く汚れている（ラットサイン）
• 夜中に天井裏や壁の中から足音やかじる音がする

種類の見分け方は「ネズミの種類と見分け方」で解説しています。

放っておくと起きること

ネズミは糞尿で食品を汚して食中毒の原因になるほか、イエダニを持ち込んだり、電線をかじって停電や火災の原因になったりします（東京都保健医療局）。京都市は、仏壇や祭壇のお供えもネズミの餌になるので注意するよう呼びかけています。

被害	内容
健康被害	糞尿で汚れた食品による食中毒、イエダニに刺される
火災・停電	天井裏や壁の中の電線をかじり、ショートの原因になる
建物・家財	土壁や断熱材を傷める、お供えや食品をかじる、糞尿のにおいとシミが残る
連棟住宅での広がり	つながった天井裏を通って、隣の住戸との間を行き来する

京都市は駆除してくれる？助成金と相談先

京都市は、ネズミの駆除は「市民の皆様自ら」行うものとしていて、医療衛生センターでは駆除方法の相談を受けています。捕獲かごの貸し出しや殺鼠剤の配布は、市のページでは確認できませんでした（衛生年報には指導用のクマリン製剤の配付量がR5年度0.6kgと載っています）。京都府も、駆除は個別に業者に頼み、費用は自己負担としています。ネズミ駆除の助成金は府・市とも確認できませんでした。

窓口	担当	電話
医療衛生センター 北東部	北区・上京区・左京区・東山区	075-746-7211
医療衛生センター 中部	中京区・下京区	075-746-7212
医療衛生センター 南東部	山科区・南区・伏見区	075-746-7213
医療衛生センター 西部	右京区・西京区	075-746-7214
京都保健衛生協会	駆除の相談（府が案内）	075-681-1727
京都府ペストコントロール協会	電話相談は無料。事業者を紹介することもある（現地調査・施工は原則有料）	0120-064-074

府の登録一覧で業者を確かめる

京都府は、建築物ねずみ昆虫等防除業の登録業者の一覧を公開しています（2026年9月8日更新、42件）。この記事で紹介する業者のうち、相互衛生管理研究所・トータルクリーン京都支社・グラックス・大和薬業は一覧に載っています。登録は主にビルなどの防除を行うためのものですが、業者を選ぶときの目安になります。ほかの自治体の支援の例は「ネズミ駆除の助成金・補助金はある？」でまとめています。

京都のネズミ駆除の費用

京都の業者が公表している料金は次のとおりです。最低料金の「〜」には、封鎖や清掃が含まれていないことが多い点に注意してください。

業者	公表している料金	備考
マイジョリティサービス（南区）	スポット駆除 8,800円〜、防鼠工事 1か所11,000円〜、飲食店の毎月訪問 9,900円〜／月（税込）	京町家の飲食店の事例あり
グラックス（伏見区）	スポット 15,000円〜、定期管理 8,000円〜／月	殺鼠剤はほとんど使わない
トータルクリーン京都支社（西京区）	基本セット（毒餌トラップ・消毒・侵入口閉鎖）27,500円〜、点検・管理（2週間に1回）22,000円〜	現地調査費がかかる場合あり
ライフディフェンス（右京区）	見積もり例 83,000円	長屋の床下は最大15万円
ラット	一戸建て 3万〜25万円が目安	最長3年保証

見積もり例：毒エサ＋追い出し＋閉鎖で83,000円

ライフディフェンスは、見積もりの例として、毒エサ8,000円、追い出し45,000円、侵入口の閉鎖30,000円の合計83,000円を公開しています。箇所別の平均価格は天井裏25,000円、屋根裏50,000円で、長屋の床下は内部から施工するため最大15万円になるとしています。

ライフディフェンスの見積もり例	金額
毒エサ	8,000円
追い出し	45,000円
侵入口の閉鎖	30,000円
合計	83,000円

全国的な目安は「ネズミ駆除の費用相場」で解説しています。

「一軒家約5,000円〜」で約13万円の事例

国民生活センターは、ネットに「一軒家約5,000円〜」と表示していた業者にネズミ駆除を頼んだら、約13万円を請求された事例を紹介しています。害虫・害獣駆除の相談は2023年度に前年同期の約1.5倍に増えました。京都市消費生活総合センターの「安心安全情報」第146号でも、「緊急」を装った害虫駆除の高額請求が取り上げられています。

訪問販売にあたる契約なら、クーリング・オフができる場合があります。困ったときは京都市消費生活総合センターか「188」に相談してください。

京都のネズミ駆除おすすめ業者7選

京都市内に本社・支社を置く会社を中心に、公式サイトでネズミ駆除の作業内容を確認できた7社を紹介します。府の登録一覧と、日本ペストコントロール協会の名簿に載る京都府協会の会員かどうかもあわせて確認しました。

業者	拠点	料金の公表	保証	府の登録／協会
相互衛生管理研究所	伏見区	なし	未記載	登録○・協会○
マイジョリティサービス	南区	8,800円〜	未記載	―
ライフディフェンス	右京区	見積もり例を公表	1年（1か月後に無料点検）	―
トータルクリーン京都支社	西京区	27,500円〜	保証期間内は再訪問	登録○・協会○
グラックス	伏見区	15,000円〜	未記載	登録○
大和薬業	山科区	なし	種類により保証あり	登録○・協会○
ラット	大阪・兵庫	総額の目安を公表	最長3年	―

株式会社相互衛生管理研究所｜伏見区・寺社や旅館を手がける老舗

• 1968年事業開始
• 府知事登録 23ね第14号
• 年間管理は12か月の分割払い

京都市伏見区深草の会社で、創業者は元京都市の衛生行政職員です。調査、駆除施工、毎月の巡回による保守の流れで対応し、年間管理は12か月の分割払いができます。寺社・旅館・京料理店などの実績があり、日本ペストコントロール協会の優良事業所です。個人宅のネズミの料金は問い合わせ制です。（公式サイト：sougoeisei.jimdofree.com）

向いている人：寺社や旅館、老舗の店舗で、年間を通して管理してほしい

株式会社マイジョリティサービス｜南区・京町家の飲食店の事例

• スポット駆除 8,800円〜
• 1級建築士が在籍
• ファイバースコープで調査

京都市南区久世上久世町の会社で、「京都の害虫駆除.com」を運営しています。個人のスポット駆除は8,800円〜、防鼠工事は1か所11,000円〜、飲食店の毎月訪問は9,900円〜／月（税込）と料金を公表しています。東山区の京町家を改装した飲食店で、点検口のない天井裏の死骸をファイバースコープで探して撤去した事例（2025年8月）を公開しています。防除作業監督者、1級建築士、わな猟の資格者がいます。（公式サイト：keiji-pestcontrol.com）

向いている人：町家で点検口がなく、天井裏の様子がわからない

株式会社ライフディフェンス｜右京区・1年保証と1か月後の無料点検

• 見積もり例 83,000円を公開
• 完了1か月後に無料点検
• 保証後の再発も上限3万円で再施工

京都市右京区西院に本社、久御山町に営業所がある会社です。見積もりの内訳例と箇所別の平均価格を公開し、駆除後は1年間の保証がつきます。完了から1か月後に無料点検があり、保証期間が過ぎてから再発した場合も上限3万円で再施工するとしています。（公式サイト：www.l-defense.com）

向いている人：料金の内訳と、保証が切れた後の対応まで知っておきたい

株式会社トータルクリーン 京都支社｜西京区・基本セット27,500円〜

• 毒餌トラップ・消毒・閉鎖のセット
• 2週間ごとの点検・管理
• ペストコントロール1級技術者が在籍

兵庫県川西市に本社を置き、京都市西京区大枝中山町に京都支社がある会社です。毒餌トラップ、消毒、侵入口の閉鎖をまとめた基本セットが27,500円〜、2週間に1回の点検・管理が22,000円〜です。現地調査費がかかる場合があるので、問い合わせの際に確認しましょう。（公式サイト：total-clean.co.jp）

向いている人：閉鎖までまとめたセット料金で頼みたい

グラックス｜伏見区・殺鼠剤をほとんど使わない

• スポット 15,000円〜
• 府2ね第4号の登録
• 連棟住宅の事例を公開

京都市伏見区淀の会社です。殺鼠剤はほとんど使わず、捕獲、侵入口の閉鎖、超音波機器で対策する方針です。スポットは15,000円〜、定期管理は8,000円〜／月で、京都市北区の連棟住宅で住戸全体をまとめて追い出し、後日侵入口を閉鎖した事例（2026年1月）を公開しています。ネズミの保証は公式サイトでは確認できませんでした。（公式サイト：gaichukujo.jp）

向いている人：小さな子どもやペットがいて、薬剤をなるべく使いたくない

大和薬業株式会社｜山科区・保健所からの依頼も受ける

• 1964年創業
• 府3ね第3号の登録
• 文化財虫菌害防除作業主任者が在籍

京都市山科区の会社で、保健所や役所からの依頼も受けています。電話、調査、見積もり、施工、完了報告の流れで対応し、駆除の種類によって保証があるとしています。ネズミの料金と保証年数は公表されていません。（公式サイト：www.daiwayakugyou.co.jp）

向いている人：寺院や古い建物など、文化財に配慮した対策をしたい

株式会社ラット｜京都市に対応・最長3年保証

• 現地調査・見積もり無料
• 最長3年の再発保証
• 保証対象外のケースを明示

西宮市に本社、大阪に本部を置き、京都市にも対応する会社です。一戸建ての費用の目安を3万〜25万円と公表し、最長3年の再発保証をつけています（建物の状況で短くなる場合あり）。保証の対象外になるケースもサイトで説明しています。（公式サイト：rat-kujo.co.jp）

向いている人：保証の条件をはっきりさせてから契約したい

大手チェーン・全国対応のサービス

京都府ペストコントロール協会の無料電話相談で業者を紹介してもらう方法のほか、全国対応の駆除サービスにも見積もりを頼むと、料金と作業内容を比べやすくなります。

京都でネズミ駆除業者を選ぶ6つのポイント

ポイント	確認すること
1. 調査と効果判定をするか	最初に侵入口と通り道を調べ、作業後に効果を確かめてくれるか。東京都は、生息調査と効果判定を行う業者かを確認するよう案内している
2. 封鎖の範囲と箇所数	何か所ふさぐのか、1か所いくらか。封鎖をしないと別のネズミが入ってくる
3. 清掃・消毒が含まれるか	糞尿の清掃や消毒がオプションになっていないか
4. 保証の期間と対象	再発したときの保証は何年か、どの箇所が対象か
5. 地元の登録・協会加盟	京都府ペストコントロール協会の会員か、建築物ねずみ昆虫等防除業の登録があるか
6. 町家・連棟住宅の経験	点検口のない天井裏や、隣とつながった建物の施工事例があるか

不安をあおって契約を急がせる業者は避けるよう、東京都も注意を呼びかけています。最低でも2〜3社から見積もりを取り、同じ条件で並べて比べましょう。業者の比べ方は「ネズミ駆除業者の選び方と費用相場」でも詳しく解説しています。

依頼から完了までの流れ

1. 問い合わせ：被害の場所、音のする時間帯、糞の有無などを伝える
2. 現地調査：侵入口・通り道・巣の場所を調べる（無料の業者が多いが、調査だけだと有料の業者もある）
3. 見積もり：封鎖の箇所数、清掃・消毒、訪問回数、保証を確認する。その場で契約を急がない
4. 駆除：トラップや毒餌で数を減らす。数週間〜2か月かかることもある
5. 封鎖・清掃：家の中のネズミがいなくなってから侵入口をふさぎ、糞尿を清掃・消毒する
6. 効果確認・保証：一定期間ネズミが出ないことを確かめ、保証書を受け取る

自分で対策するなら｜京都市が案内する基本

家ネズミは鳥獣保護管理法の対象外なので、許可なく自分で捕まえて問題ありません（環境省）。京都市は、ご家庭でできるネズミ対策として次の点を挙げています。

対策	具体的にすること
すき間をふさぐ	1cm以上の穴を点検し、モルタル・パテ・金網・金属たわしでふさぐ
餌を置かない	食品は密閉し、仏壇や祭壇のお供えも出しっぱなしにしない
殺鼠剤は冬に	死骸の悪臭を避けるため、殺鼠剤は冬場に使う

数を減らすには、糞やこすり跡がある通り道に粘着シートを並べます。町家の通り庭や台所の壁ぎわなど、ネズミが壁に沿って移動する場所が狙い目です。

中にネズミがいるうちに入り口だけふさぐと閉じ込めてしまうので、数を減らしてからふさぎましょう。点検口のない天井裏や、隣とつながった連棟住宅では、自分での対策には限界があります。手順の詳細は「ネズミ駆除を自分でする方法」、殺鼠剤の選び方は「ネズミ駆除剤（殺鼠剤）のおすすめと選び方」をご覧ください。

賃貸住宅・店舗でネズミが出た場合

賃貸の家やマンションでネズミが出たときは、まず管理会社か大家さんに連絡してください。京都市でも、駆除は建物の所有者や管理者が行うものとされています。壁や床に穴をあける封鎖工事は建物の構造にかかわるため、入居者が勝手に業者を呼ぶ前に、費用の負担をだれがするか確認しておくと安心です。

飲食店や店舗は、食品を扱う分だけ被害が大きくなりやすく、1回の駆除より月1回などの定期点検で管理するのが一般的です。年間契約のプランを用意している業者も多いので、見積もりの際に定期管理の料金もあわせて聞いておきましょう。

京都でネズミの相談ができる窓口

窓口	内容
京都市 医療衛生センター（北東部7211・中部7212・南東部7213・西部7214、市外局番075-746）	駆除方法の相談
京都保健衛生協会（075-681-1727）	駆除の相談（府が案内）
京都府ペストコントロール協会（0120-064-074）	無料の電話相談、事業者の紹介
京都市消費生活総合センター／消費者ホットライン188	高額な見積もりや契約のトラブルの相談

京都のネズミ駆除でよくある質問

京都市はネズミを駆除してくれますか？

駆除はしていません。京都市は駆除を市民自ら行うものとし、医療衛生センターで駆除方法の相談を受けています。

京都でネズミ駆除の助成金はありますか？

京都府・京都市とも、ネズミ駆除の助成金は確認できませんでした。府のFAQでも、駆除は個別に業者に頼み、費用は自己負担としています。

町家でもネズミ駆除はできますか？

できます。点検口のない天井裏をファイバースコープで調べた事例（マイジョリティサービス）や、連棟住宅の住戸全体をまとめて追い出した事例（グラックス）があります。町家や連棟住宅の経験があるか、見積もりの際に確認しましょう。

業者に頼むといくらかかりますか？

スポット駆除は8,800円〜15,000円程度からありますが、追い出しや閉鎖を含めると8万円前後、長屋や天井裏の範囲が広いと十数万円になることもあります。ライフディフェンスの見積もり例は83,000円でした。

駆除にはどれくらいの期間がかかりますか？

1回で終わる場合もありますが、トラップや毒餌で数を減らし、いなくなってから侵入口をふさぐ流れだと、数週間から2か月ほどかかるのが一般的です。訪問回数で料金が変わる業者が多いので、見積もりの際に回数と期間を確認してください。

まとめ｜京都のネズミ駆除は町家に強い地元業者の見積もり比較から

京都市のネズミ駆除指導は令和5年度に189件で、右京区が最も多くなっています。市や府は駆除や助成をしていないので、まずは医療衛生センターか京都府ペストコントロール協会の無料電話相談で、対策の方法を聞いてみましょう。

町家や連棟住宅は侵入口が見つけにくいため、同じような建物の施工事例がある業者を選ぶのがポイントです。最低料金ではなく、追い出し・閉鎖・清掃・保証まで含めた総額で2〜3社を比べてください。

• 大阪のネズミ駆除業者
• ネズミ駆除の費用相場
• ネズミ駆除業者の選び方と費用相場
• ネズミ駆除を自分でする方法
• ネズミ駆除の助成金・補助金はある？
• ネズミ駆除剤（殺鼠剤）のおすすめと選び方
• 超音波ネズミ駆除器は効果ある？

参考にした資料

• 京都市「ご家庭でできるネズミ対策」
• 京都市衛生年報 令和6年版
• 京都市衛生年報 令和5年版
• 京都市 FAQ（ネズミの駆除）
• 京都府 よくある質問（ネズミ駆除の相談先）
• 京都府 建築物ねずみ昆虫等防除業 登録一覧
• 京都府ペストコントロール協会
• 日本ペストコントロール協会 会員名簿（2024年7月31日）
• 国民生活センター（2024年4月24日）害虫・害獣駆除のトラブル
• 京都市消費生活総合センター「安心安全情報」第146号
• 東京都保健医療局 ねずみ対策パンフレット
• 環境省「鳥獣保護管理法の概要」